Joxean Muñoz (Donostia, 1957) llegó a la dirección de Tabakalera en enero de 2006 para liderar un equipo que completaban Iñaki Galarraga y Santi Eraso como directores de Arquitectura y de Contenidos, respectivamente. Perteneciente a una conocida familia donostiarra -su padre es autor de varios libros sobre historia de San Sebastián, mientras que uno de sus hermanos forma parte del trío de payasos Gari, Lontxo eta Joselontxo-, Muñoz es licenciado en Historia del Arte. A finales de los años setenta fue uno de los impulsores de la revista 'Oh Euskadi!' y en 1984 publicó el poemario 'Parentesiak (eta abar)'. En colaboración con Txabi Basterretxea, comisarió varias exposiciones, entre las que destaca 'Atarian-La ciudad de tu vida' que en 2000 ocupó San Telmo con una original visión de la historia de la capital donostiarra. Codirector y coguionista de la película de animación 'Karramarro uhartea', Muñoz escribió entre 2000 y 2003 una columna semanal en DV titulada 'Begikoak'.
Joxean Muñoz llegaba a la dirección de Tabakalera una vez que se descartara el nombre de José Miguel Ayerza. «El proyecto está en un momento maravilloso», aseguraba el nuevo director, quien consideraba que los catorce meses fijados para definir el proyecto eran «de entrada, un plazo razonable para llegar a un punto de acuerdo sobre los temas más concretos y definitivos y, a partir de ahí, abordar los trabajos puramente arquitectónicos». Muñoz prefería no valorar el informe de la consultora Bearing Point, a la espera de conocerlo a fondo, pero anunciaba que con su nombramiento se producía «un giro y un nuevo comienzo del proyecto».
Cuando en abril de 2008, las instituciones decidieron ubicar en el Koldo Mitxelena la Biblioteca Nacional Vasca -que hasta ese momento, se preveía instalar en Tabakalera- señaló que el acuerdo suponía «el impulso definitivo a Tabakalera. Por parte de las instituciones, este acuerdo da coherencia interna al proyecto, ahora sí, claramente vinculado a la cultura audiovisual». Y es que Muñoz siempre ha defendido una definición de Tabakalera como «un centro de producción, exhibición, debate, formación, archivo y distribución de la cultura visual». También en 2008, el centro inauguró una gran 'T' como logotipo de la fábrica para «durar mucho y adaptarse a todo tipo de situaciones».
Y a finales de ese mismo año, el proyecto 'Tres en raya' ganaba el concurso de rehabilitación arquitectónica. El entonces director señalaba que «el proyecto tiene que ser versátil para que se mantenga siempre contemporáneo» y reconocía que los usos y los costes habían determinado la elección. Hasta entonces, Muñoz se había dedicado a explicar «a (Julian) Schnabel y a otra gente» partidarios de conservar el edificio «tal y como está» que la remodelación preservaría su carácter fabril, pero era necesaria.
Mientras, por diversas razones, las previsiones de apertura del centro se fueron retrasando: 2011, primero; 2012, después, y 2013 más tarde. El pasado enero, declaraba que «en estos momentos, se contempla 2013. Nunca hemos dicho si será el 1 de enero o el 31 de diciembre porque no lo sabemos». Y añadía: «Toda obra tiene su dificultad y sus sorpresitas. Algunas ya las hemos tenido». Además, reconocía que la determinación que a pesar de la crisis aún presentaban las instituciones de «hacer (la obra) y en las fechas previstas es muy valiente y un apoyo inequívoco al proyecto».
Lo sucedido desde entonces y especialmente durante esta última semana ha supuesto tal convulsión del proyecto que Muñoz ha optado por dejar el cargo.